A história da GLEMT começa quando Mato Grosso ainda era um único Estado. O ponto de partida foi dado em Aquidauana, hoje Mato Grosso do Sul, quando foi fundada a Grande Loja Maçônica do Estado de Mato Grosso, em 24 de novembro de 1962. Logo, a sede da administração central foi estabelecida em Campo Grande, capital do Estado irmão.

Com a divisão do Estado na década de 1970, criando Mato Grosso do Sul, Mato Grosso criou a sua Grande Loja em 07 de outubro de 1978.

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